子宮内膜症とは、本来なら子宮の内側をおおっている組織が、子宮の外側に増殖してしまう病気です。子宮内膜はエストロゲンやプロゲステロンの作用によって、厚くなったり剥がれ落ちたり（生理）しますが、子宮以外の増殖した内膜も、これと同じ現象が起こってしまいます。

子宮内膜症が発症しやすい場所は骨盤内の下腹部の、ダグラス窩、直腸、虫垂、膀胱などです。卵巣内に子宮内膜症が発症することも多く、逃げ場のない月経がドロドロに溜まってチョコレートのようになることから「チョコレート嚢胞」と呼ばれています。
月経がある女性の10人1人は「子宮内膜症」といわれていて、そして不妊原因の第1位がこの子宮内膜症です。子宮内膜症のことを、エンドメトリオージス（Endometriosis）と呼ぶこともあります。